Harbour fue el proyecto inicial y tenia como objetivo crear un compilador 100% compatible con Clipper, cosa que se logro con bastante buen exito.
xHarbour se llama asi por eXtended Harbour, es decir, Harbour extendido y contiene una serie de mejoras y extensiones a Harbour para hacerlo mas completo, aunque tengo entendido que Harbour actualmente ya cuenta con una buena cantidad de las extensiones de xHarbour implementadas.
Personalmente yo uso xHarbour porque ademas utilizo otras herramientas de programación basadas en este producto, que no están disponibles con Harbour o no son compatibles con el, como el XBscript.
Hay una version en linea gratuita que puedes consultar para que veas todas las extensiones que xHarbour aporta en:
http://www.xharbour.com/xHDN/referenceguide/Nos vemos en Chile a partir del 12 de Octubre y en Argentina el 3 de Noviembre.